柴山多杯孔珊瑚是一級保育物種，桃園大潭為全球最大棲地，但中油三接工程也在此興建，為此引起全國公投激辯。公投落幕後，三接工程動工，但環團監測指出，工程導致環境巨變擾動，柴山多杯孔珊瑚大幅死亡，為全球生態重要損失。環團要求與中油共同現堪，經濟部應要求中油提出詳盡報告書，若有必要應停工。
一級保育物種面臨生存危機，民團擔心生態逐漸消失
搶救大潭藻礁行動聯盟召集人潘忠政指出，在進行長期監測後發現，大潭藻礁海域出現多個點位有珊瑚被泥埋、死亡甚至「看不到屍骨」，因為被砂磨掉了。
藻礁生態熱點位在工程 G1、G2 區，潘忠政指出，海保署調查顯示去（2025）年下半年柴山多杯孔珊瑚的數量約在 66 至 118 株之間變動，但在去年第三季，未發現 G1 區有柴山多杯孔珊瑚，出現 0 株的紀錄，第四季也只發現 17 株；後來中油表示找到了 48 株，但潘忠政認為，找到 48 株，不代表它的狀態很好、可接受。
根據潘忠政及志工團隊統計，在 G1 區 113 個點位，柴山多杯孔珊瑚的存活狀態尚可的約有 15 株，狀況不佳的有 28 株，存活率約 41.4%，然而，存活變死亡或疑似死亡的最多，有 38株（36.5%），屍骨難覓的則有23 株（22%）。G2 區則是泥埋嚴重，在 141 株裡有 61 株珊瑚因泥埋嚴重，狀態不佳（50%），其次則是屍骨難覓，有 37 株（30%），「就算是存活，狀態也和之前差很多。」
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